氟桂利嗪最常见的不良反应就是引起中枢神经系统的症状，比如会出现困倦、嗜睡，还有乏力、四肢无力的感觉，这是一个比较常见的不良反应，比较多的人可能都会出现。一般来说会随着用药时间延长，这种发生率和严重程度也会逐渐地下降，患者在后面的用药时间内可能会耐受这个药物。

另外氟桂利嗪有可能导致患者出现精神系统方面的不良反应，比如患者可能会出现情绪的改变，情绪低落，有些患者可能会出现抑郁。研究表明，女性患者更容易出现这种精神、情绪的改变，女性患者相对于男性更容易发生抑郁，这个也是它一个比较重要的不良反应。

另外有可能会引起患者出现帕金森病的类似症状，或者锥体外系的症状，比如患者可能会出现不自主运动，比如震颤，还有可能会出现面部表情僵硬，都是和它所引起的锥体外系的症状，或者类似帕金森的症状相关。流口水也是锥体外系反应或者帕金森病的一个表现，和氟桂利嗪有一定的相关性，但是发生率并不高，主要还是不自主的运动或震颤。

这就是氟桂利嗪主要的不良反应，总体来说主要是集中在神经精神系统方面，另外和其他的药品一样，可能会引起胃肠道的反应，比如恶心、呕吐，还有它经过肝脏代谢，对于个别患者有可能会引起肝功能异常，肝功能异常可能和其他的药物不良反应比较相似，也都是比较常见的不良反应。